V prípade turniketového systému je potrebné definovať aj režim zamietnutia vstupu, t. j. správanie zariadenia v prípade, že používateľ nemá platné oprávnenie na prechod. K zamietnutiu môže dôjsť napríklad v prípade neplatného QR kódu, expirovaného lístka, neoprávnenej karty, opakovaného použitia jednorazového kódu alebo pokusu o vstup mimo povoleného času.
V prípade zamietnutia vstupu zostáva turniket mechanicky zablokovaný pred vstupom do kontrolovaného priestoru. Systém môže tiež varovať pomocou svetelného alebo zvukového signálu, prípadne zobrazovať informácie na displeji čítačky. Odporúča sa, aby správa pre používateľa bola jednoznačná, napríklad „vstup zamietnutý“, „neplatný kód“ alebo „oprávnená osoba nebola nájdená“.
Z technického hľadiska sa zamietnutie vyhodnocuje v riadiacej jednotke, prístupovom softvéri alebo v nadradenom systéme, ktorý overuje identifikátor používateľa. Po negatívnom vyhodnotení sa príkaz na uvoľnenie prechodu neodošle turniketu, alebo sa odošlú informácie o stave zamietnutia. Udalosť je možné zaznamenať aj v protokole vrátane času, typu identifikátora a dôvodu zamietnutia.
Je dôležité, aby odmietnutie vstupu neblokovalo prevádzku používateľov a aby sa systém po neúspešnom pokuse prepol späť do štandardného režimu. Pri vyššej intenzite prevádzky je potrebné zabezpečiť navigáciu pre používateľov, napríklad odporúčanie použitia alebo použitia iného prístupového bodu.
Správne nastavenie režimu vstupu zvyšuje bezpečnosť zariadenia, umožňuje vstup do vchodu a zároveň umožňuje obsluhe spätne vyhodnotiť neúspešné pokusy o prechod cez turniket.